การรักษาโรคฝีคัณฑสูตรด้วยเลเซอร์เป็นวิธีการรักษาสมัยใหม่ที่มีการผ่าตัดเล็ก (minimally invasive) โดยสามารถปิดทางเดินของทวารได้อย่างแม่นยำ ทำให้เจ็บน้อย ฟื้นตัวเร็ว และมีความเสี่ยงต่อการกลั้นอุจจาระไม่อยู่ต่ำกว่า เมื่อเทียบกับการผ่าตัดแบบดั้งเดิม
ขั้นตอนการรักษาด้วยเลเซอร์ คือ การใส่เส้นใยเลเซอร์ที่บาง และยืดหยุ่นเข้าไปในทางเดินของทวาร เมื่อวางตำแหน่งเรียบร้อยแล้ว เลเซอร์จะปล่อยพลังงานเพื่อทำให้ช่องทางนั้นหดตัว และปิดจากด้านใน โดยยังคงรักษากล้ามเนื้อ และเนื้อเยื่อรอบ ๆ ไว้โดยไม่ต้องกรีดแผลใหญ่ จากนั้นเส้นใยเลเซอร์จะค่อย ๆ ถูกดึงออกมา พร้อมกับปล่อยพลังงานไปตลอดทาง ทำให้ปิดทวารได้อย่างมีประสิทธิภาพ คล้ายกับการรูดซิป